Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms