Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
KIF5AQ12840 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
KIF5AQ12840 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
KIF5AQ12840 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
KIF5AQ12840 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
KIF5AQ12840 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms