Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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