Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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