Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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TM6SF1Q9BZW5 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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TM6SF1Q9BZW5 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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