Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RNF17Q9BXT8 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms