Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
LRRIQ1Q96JM4 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.9 ms