Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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ZNF548Q8NEK5 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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ZNF548Q8NEK5 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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ZNF548Q8NEK5 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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ZNF548Q8NEK5 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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ZNF548Q8NEK5 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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ZNF548Q8NEK5 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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ZNF548Q8NEK5 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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ZNF548Q8NEK5 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ZNF548Q8NEK5 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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