Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms