Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CA9Q16790 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CA9Q16790 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms