Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 IGHVIII-13-1-201ENST00000517613 291 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 DOPEY2-202ENST00000399151 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CCDC144B-208ENST00000618081 8688 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SZT2-209ENST00000562955 13968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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HERC1Q15751 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ITGA11-202ENST00000423218 10192 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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