Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SS18Q15532 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms