Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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