Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXD4Q12950 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXD4Q12950 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXD4Q12950 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXD4Q12950 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXD4Q12950 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXD4Q12950 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXD4Q12950 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXD4Q12950 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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