Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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PGGT1BP53609 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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PGGT1BP53609 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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PGGT1BP53609 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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