Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
UTRNP46939 PRICKLE1-213ENST00000639589 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 VPS8-227ENST00000625842 4969 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UTRNP46939 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
UTRNP46939 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
UTRNP46939 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
UTRNP46939 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
UTRNP46939 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
UTRNP46939 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
UTRNP46939 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
UTRNP46939 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
UTRNP46939 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
UTRNP46939 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
UTRNP46939 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
UTRNP46939 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
UTRNP46939 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
UTRNP46939 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 PCDHA10-203ENST00000562220 12358 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 GIGYF2-202ENST00000409196 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 SVEP1-203ENST00000401783 12350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UTRNP46939 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UTRNP46939 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UTRNP46939 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms