Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD12P35452 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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