Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms