Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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RNF17Q9BXT8 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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RNF17Q9BXT8 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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RNF17Q9BXT8 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
RNF17Q9BXT8 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
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