Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms