Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 ZCWPW2-201ENST00000383768 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD42Q8N9B4 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms