Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCBE1Q6UXH8 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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