Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RTL8BQ17RB0 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.28□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RTL8BQ17RB0 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
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