Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NTRK2Q16620 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms