Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMCO1Q147U7 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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