Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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