Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NME3Q13232 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NME3Q13232 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NME3Q13232 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms