Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms