Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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