Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFFO1Q0D2I5 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms