Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPS29P62273 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPS29P62273 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms