Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRKCHP24723 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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