Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD8P13378 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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