Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 ADH4-209ENST00000508393 2151 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXQ1Q9C009 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms