Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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TM6SF1Q9BZW5 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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TM6SF1Q9BZW5 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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TM6SF1Q9BZW5 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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TM6SF1Q9BZW5 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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TM6SF1Q9BZW5 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TM6SF1Q9BZW5 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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