Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C17orf47Q8NEP4 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms