Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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