Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms