Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXE3Q13461 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXE3Q13461 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXE3Q13461 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXE3Q13461 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXE3Q13461 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXE3Q13461 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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