Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM28Q13263 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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