Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms