Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP1B1Q10567 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
AP1B1Q10567 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
AP1B1Q10567 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
AP1B1Q10567 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
AP1B1Q10567 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
AP1B1Q10567 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP1B1Q10567 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP1B1Q10567 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP1B1Q10567 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP1B1Q10567 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
AP1B1Q10567 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms