Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
HOXD10P28358 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms