Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRAP3Q9Y2W1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms