Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF13BQ9Y275 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms