Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MED23Q9ULK4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms