Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND2AQ9ULE3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms