Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA11Q9UKX5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA11Q9UKX5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms