Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA1Q9UJY5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms