Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RIMS3Q9UJD0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms